Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms