Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms