Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC9Q9Y397 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC9Q9Y397 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms