Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LEMD3Q9Y2U8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms