Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3M1Q9Y2T2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms