Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms