Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAPRE3Q9UPY8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms