Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms