Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms