Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms