Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms