Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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