Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNFX1Q9P2E3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNFX1Q9P2E3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms