Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNRD1Q9P1U0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms