Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms