Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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HOXC10Q9NYD6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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HOXC10Q9NYD6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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HOXC10Q9NYD6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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