Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHCHD3Q9NX63 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD3Q9NX63 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms