Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLE3Q9NRF9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms