Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms