Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms