Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms