Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLCO1B3Q9NPD5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms