Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUFT1Q9NNX1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms