Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOPCQ9HD26 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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