Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSPNQ9HAW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSPNQ9HAW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms