Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP3Q9H9T3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms