Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6AQ9H2E6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6AQ9H2E6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms