Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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