Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms