Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPPA2Q9BXP8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms