Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3Q9BXJ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms