Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms