Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms