Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms