Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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