Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms