Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms