Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NICN1Q9BSH3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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