Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms