Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms