Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms