Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms