Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF11Q99590 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF11Q99590 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms