Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RSF1Q96T23 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms