Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms