Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP4Q96P64 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP4Q96P64 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms