Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC43Q96MW1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms