Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms