Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms