Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms